Por ahora, parece que el .gitignore puede quedar así:
docs/
img/
*.aux
*.bkp
*.lof
*.log
*.out
*.toc
Más inspiración: ConTeXt generates .tuc files (utility cache) during each run. (No es mi caso ahora, me he ido por Tex Live).
De hecho, el Sergio Galindo dice en la convocatoria que no quieren imágenes ni dibujos, sólo el texto. En docs tengo mis notas, una especie de diario del proyecto, la bitácora, no el proyecto.
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